Tras la disolución de la Unión Soviética en 1991, se establecieron relaciones diplomáticas con la independencia de Tayikistán. La posición de Tayikistán en Asia Central era una posición estratégicamente importante en la frontera con Afganistán, la República Popular de China, corredor del norte de Gilgit-Baltistán ( Cachemira controlada por Pakistán ).
El papel de India en la lucha contra los talibanes y Al Qaeda y su rivalidad estratégica con China y Pakistán han hecho que sus lazos con Tayikistán sean importantes para sus políticas estratégicas y de seguridad.
En 1996-97, el Ala de Investigación y Análisis (RAW) inició negociaciones con Tayikistán para utilizar la Base Aérea Farkhor para transportar suministros militares a gran altitud a la Alianza del Norte de Afganistán, dar servicio a sus helicópteros y reunir inteligencia. En ese momento, India operaba un pequeño hospital militar en la región de Farkhor. El hospital de Farkhor se usaba para tratar a miembros de la Alianza del Norte afganos heridos en la lucha con los talibanes, incluido el líder militar Ahmed Shah Massoud, quien fue trasladado allí después del ataque suicida contra él. En 2002, India reconoció que estaba estableciendo una base aérea en Farkhor. Fue asegurado con ayuda de Rusia. La base aérea estaba en mal estado y no se utilizaba desde la década de 1980. El gobierno indio otorgó una licitación de $ 10 millones a un constructor privado en 2003 para restaurar la base aérea en 2005. Después de que el constructor incumplió, la Organización de Carreteras Fronterizas intervino para completar el trabajo.
Se especuló que el uso de la base incluía la adquisición de activos militares y energéticos de las antiguas repúblicas soviéticas de Asia Central, dada la dependencia principal de India del armamento soviético / ruso. India también ve las bases que brindan acceso a los recursos petroleros y energéticos de Asia Central. India también prometió ayudar en la defensa de Tayikistán y está entrenando a la Fuerza Aérea de Tayikistán .
Aunque la presencia de una base aérea india en Farkhor ha sido objetada por Pakistán, que lo ve como una amenaza.
India es solo la cuarta nación después de Estados Unidos, Rusia y Alemania en tener una base militar en Asia Central. 
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Enlaces- Base aérea de Farkhor
Relaciones India-Tayikistán