A diferencia de los laboratorios de pruebas atómicas de Pakistán, India podía hacer muy poco para ocultar su actividad en Pokhran. A diferencia de las montañas de granito a gran altitud, los arbustos son escasos y las dunas en el desierto de Rajasthan no proporcionan mucha cobertura de los satélites de sondeo. La inteligencia india había estado al tanto de los satélites espías de los EE. UU. Y la CIA estadounidense había detectado preparaciones de pruebas indias desde 1995; por lo tanto, las pruebas requerían un secreto completo en la India y también para evitar ser detectados por otros países.
Un grupo muy pequeño de científicos, altos oficiales militares y altos políticos hicieron una extensa planificación para garantizar que los preparativos de las pruebas permanecieran en secreto, e incluso los altos miembros del gobierno indio no sabían lo que estaba sucediendo. El principal asesor científico y el director de la Organización de Investigación y Desarrollo de Defensa, Abdul Kalam, y el Dr. R. Chidambaram, director del Departamento de Energía Atómica, fueron los principales coordinadores de esta planificación de pruebas. Los científicos e ingenieros del BARC, el AMDER y el DRDO estuvieron involucrados en el ensamblaje, diseño, detonación y obtención de armas nucleares. Un grupo muy pequeño de científicos de alto nivel estuvo involucrado en el proceso de detonación, todos los científicos debían usar uniformes del ejército para preservar el secreto de las pruebas.
Desde 1995, el 58º Regimiento de Ingenieros había aprendido a evitar la detección de satélites. El trabajo se realizó principalmente durante la noche, y el equipo se devolvió al lugar original para dar la impresión de que nunca se movió. Se cavaron pozos de bombas bajo redes de camuflaje y la arena excavada tenía forma de dunas con forma. Los cables para los sensores se cubrieron con arena y se ocultaron con vegetación nativa. No partirían hacia Pokhran en grupos de dos o tres. Viajaron a un destino diferente a Pokhran con seudónimos, y luego fueron transportados por el ejército. El personal técnico en el campo de pruebas llevaba uniforme militar, para evitar la detección en imágenes satelitales.
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