Esto ha variado según las principales armadas involucradas. Los japoneses tenían complementos de barcos específicos para cada uno de sus portaaviones. Esta es la razón por la que Zuikaku, que no sufrió daños en la Batalla del Mar de Coral, pero había perdido un número significativo de aviones y tripulaciones, perdió la batalla de Midway, estaba entrenando y reconstruyendo sus escuadrones.
Para la Royal Navy, anterior a 1939, el Fleet Air Arm era una parte de la RAF y de escuadrones individuales donde se les asignaba y entrenaba en aviones específicos para uso naval. Los pilotos de estos escuadrones podrían rotarse según sea necesario o rotar todo el escuadrón. Después de 1939, estos escuadrones se convirtieron en parte de la RN y, aunque todavía recibían versiones navales específicas, tendían a rotar más como escuadrones enteros, generalmente de manera similar a la Marina de los EE. UU.
La Marina de los EE. UU. Llevó a cabo la separación de la compañía aérea y el grupo aéreo. Grupos aéreos y escuadrones específicos (a veces incluyendo escuadrones USMC) se asignan en total a un portaaviones como un lugar de destino. Luego se pueden rotar para entrenamiento y reconstrucción. El Grupo Aéreo siempre tenía un comandante separado que informaba tanto al capitán como a su propio comandante de ala. Los grupos aéreos eran grupos heterogéneos con escuadrones de caza, bombarderos de buceo, exploradores y torpederos. Se descubrió que este sistema era necesario para mantener a los transportistas lo más activos posible y permitía a los grupos aéreos entrenar o reequiparse en un área trasera y luego estar listos para la acción.
En cuanto a quién decide exactamente qué escuadrones se asignan a qué grupos aéreos y qué grupos aéreos se asignan a qué transportistas, la Marina de los EE. UU., Al igual que todas las demás ramas tienen una estructura de comando en el Pentágono que toma esa decisión. Otros servicios lo llaman Oficina de Recursos Humanos o algo similar.
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