¿Cuál es el punto más alto que ha alcanzado un avión (además de un cohete)?

Eso depende un poco de dónde dibujes la línea entre el cohete y el avión.

Registro de altitud de vuelo – Wikipedia

Aviones de cohetes:

El X-15 se dejó caer en la altitud (50,000 pies) por un B-52 y fue impulsado por un cohete para acelerar horizontalmente y usó tradicionalmente superficies de control de vuelo para cambiar el cabeceo, balanceo y guiñada. Fue a 108 km de altitud de América del Norte X-15 – Wikipedia y 4.500 mph.

SpaceShipOne funcionó de manera muy similar al X-15, pero fue mucho más lento, Mach 3 más o menos, pero llegó a 112 km de altitud SpaceShipOne – Wikipedia

Es sucesor, se prevé que SpaceShipTwo irá más alto. Planean lanzar a finales de este año o principios del próximo.

Los aviones Scramjet están sin piloto y aún en desarrollo, pero también se pronostica que rondarán los 100 km de altitud.

Los aviones tradicionales (piense en los aviones de combate) generalmente superan los 60,000 pies para operaciones normales, pero muchos han volado por encima de 100,000 pies para pruebas y publicidad. El Ye-266 ha sido llevado a 124,000 pies y todavía tiene el récord de aviones a reacción.

Los aviones de reconocimiento especializados como el U-2 o SR-71 operan (o lo hicieron) por encima de los 70,000 pies (el límite de altitud real todavía está clasificado).

Aunque generalmente no recomiendo Wikipedia como fuente académica de referencia, hay un muy buen tratamiento de esta pregunta en el siguiente enlace:

Registro de altitud de vuelo – Wikipedia

Recomendaría buscar sitios web en The Smithsonian, AIAA y cualquiera de los Museos de Vuelo de los Estados Unidos.

El Ye-155 ruso alcanzó 123,520 pies. Ese es el récord de altitud existente para un avión que respira aire.

Un MiG-25 Foxbat alcanzó 123,500ft (37,500m). Sin embargo, esto fue en una subida de zoom, no en un vuelo nivelado sostenido.

El SR-71 Blackbird puede sostener 85,000 pies (26,000m) en vuelo nivelado.

Un globo tripulado alcanzó 136,000 pies (41,500m).

Según Wikipedia, tenía 125.520 pies en un MIG25M.